Giáo trình Di truyền học - Chương 16: Cơ sở vậ chất di truyền
Trong tất cả các phân tử có trong tự nhiên, các axit nucleic là
“độc nhất, vô nhị” về khả năng tự sao chép (tái bản) từ các đơn
phân thành phần. Trong thực tế, đặc điểm con cái giống bố, mẹ
là kết quả của quá trình sao chép chính xác ADN và sự di
truyền của nó qua các thế hệ. Thông tin di truyền được mã hóa
bằng ngôn ngữ hóa học của ADN và được tái bản ở mọi tế bào
trong cơ thể của mỗi người chúng ta. Chính ngôn ngữ lập trình
của ADN đã điều khiển quá trình phát triển các tính trạng về
hóa sinh, giải phẫu, sinh lý và ở một mức độ nhất định là tập
tính ở mỗi cơ thể sinh vật. Chương này đề cập đến việc bằng
cách nào các nhà khoa học chứng minh được ADN là vật chất
di truyền và bằng cách nào Watson và Crick phát hiện ra cấu
trúc phân tử của nó. Đồng thời, chúng ta cũng sẽ thấy bằng
cách nào ADN có thể sao chép (cơ sở phân tử của di truyền) và
được sửa chữa. Cuối cùng, chúng ta sẽ khảo sát xem ADN cùng
với protein đã đóng gói như thế nào trong nhiễm sắc thể.
c¸ch nµy, tèc ®é sao chÐp ADN ë sinh vËt nh©n thËt t¨ng lªn. Còng gièng ë vi khuÈn, qu¸ tr×nh sao chÐp ADN ë sinh vËt nh©n thËt tiÕn vÒ c¶ hai phÝa cña bãng sao chÐp. ë hai ®Çu cña bãng sao chÐp cã ch¹c sao chÐp. §ã lµ vïng cã d¹ng ch÷ Y lµ n¬i hai m¹ch ®¬n ADN cña chuçi xo¾n kÐp t¸ch nhau ra. Cã mét sè protein tham gia vµo ho¹t ®éng th¸o xo¾n nµy (H×nh 16.13). Helicase lµ nhãm c¸c enzym cã vai trß gi·n xo¾n vµ t¸ch hai m¹ch ®¬n ra khái nhau. Mçi m¹ch ®¬n sau ®ã ®−îc sö dông lµm khu«n (m¹ch “mÑ”) ®Ó tæng hîp nªn m¹ch ADN míi. Sau khi c¸c m¹ch lµm khu«n t¸ch nhau ra, c¸c protein liªn kÕt m¹ch ®¬n, gäi t¾t lµ SSB, sÏ ®Ýnh kÕt vµo m¹ch ADN lµm khu«n vµ gióp chóng trë nªn æn ®Þnh. Sù th¸o xo¾n cña chuçi xo¾n kÐp trong vïng bãng sao chÐp sÏ lµm cho c¸c ®Çu ë ch¹c sao chÐp trë nªn bÞ vÆn xo¾n chÆt h¬n vµ h×nh thµnh lùc c¨ng. Topoisomerase lµ nhãm enzym gióp “gi¶i táa” lùc c¨ng nµy b»ng kh¶ n¨ng lµm ®øt g·y t¹m thêi c¸c liªn kÕt céng hãa trÞ trªn m¹ch ®¬n ADN, xoay c¸c m¹ch ®¬n quanh nhau ®Ó th¸o xo¾n, råi nèi chóng trë l¹i víi nhau. C¸c m¹ch ADN “mÑ” sau khi gi·n xo¾n ®−îc dïng lµm khu«n ®Ó tæng hîp c¸c m¹ch ADN míi. Tuy vËy, enzym trùc tiÕp tæng hîp ADN kh«ng cã kh¶ n¨ng khëi ®Çu qu¸ tr×nh tæng hîp chuçi polynuclotide míi; chóng chØ cã thÓ bæ sung c¸c nucleotide vµo ®Çu 3’ cña mét chuçi cã s½n nÕu nucleotide bæ sung kÕt cÆp phï hîp víi nucleotide trªn m¹ch ADN lµm khu«n. V× lý do nµy, chuçi nucleotide ®Çu tiªn ®−îc t¹o ra trong tæng hîp ADN lu«n lµ mét ®o¹n ng¾n ARN, chø kh«ng ph¶i ADN. §o¹n ARN ng¾n nµy ®−îc gäi lµ ®o¹n måi vµ ®−îc xóc t¸c tæng hîp bëi enzym primase (xem H×nh 16.13). Primase b¾t ®Çu tæng hîp ®o¹n måi tõ mét ribonucleotide (hay nucleotide ARN) duy nhÊt; sau ®ã, mçi lÇn ph¶n øng nã g¾n thªm mét ribonucleotide theo nguyªn t¾c bæ sung víi m¹ch ADN lµm khu«n. Mét ®o¹n måi hoµn chØnh, gåm kho¶ng 5 - 10 nucleotide, lóc nµy sÏ b¾t cÆp víi m¹ch khu«n. M¹ch ADN ®−îc tæng hîp míi sÏ b¾t ®Çu tõ ®Çu 3’ cña ®o¹n måi ARN. Tæng hîp m¹ch ADN míi C¸c enzym cã tªn gäi lµ ADN polymerase chÝnh lµ c¸c enzym trùc tiÕp xóc t¸c tæng hîp m¹ch ADN míi b»ng viÖc bæ sung c¸c nucleotide vµo mét chuçi s½n cã. ë E. coli, cã mét sè lo¹i ADN polymerase kh¸c nhau; tuy vËy, hai lo¹i cã vai trß chÝnh trong sao chÐp ADN lµ ADN polymerase III vµ ADN polymerase I. §Æc ®iÓm nµy ë sinh vËt nh©n thËt lµ phøc t¹p h¬n. §Õn nay, ®· cã Ýt nhÊt 11 lo¹i ADN polymerase kh¸c nhau ®· ®−îc x¸c ®Þnh; tuy vËy, nguyªn lý ho¹t ®éng chung cña chóng vÒ c¬ b¶n lµ gièng nhau. PhÇn lín c¸c enzym ADN polymerase ®Òu cÇn mét ®o¹n måi vµ mét m¹ch ADN lµm khu«n. Trªn c¬ së tr×nh tù cña m¹ch lµm khu«n, chóng bæ sung c¸c nucleotide míi däc theo m¹ch ®−îc tæng hîp míi theo nguyªn t¾c bæ sung. ë E. coli, ADN polymerase III (viÕt t¾t lµ ADN pol III) bæ sung c¸c nucleotide ADN vµo ®o¹n måi råi tiÕp tôc kÐo dµi chuçi ADN theo nguyªn t¾c bæ sung víi m¹ch lµm khu«n cho ®Õn khi kÕt thóc chuçi. Tèc ®é kÐo dµi chuçi ADN vµo kho¶ng 500 nucleotide mçi gi©y ë vi khuÈn, vµ vµo kho¶ng 50 nucleotide mçi gi©y ë ng−êi. Mçi nucleotide khi ®−îc bæ sung vµo chuçi ADN ®ang kÐo dµi ®Òu ë d¹ng nucleotide triphosphate; ®ã lµ mét nucleoside (gåm ®−êng pentose vµ baz¬ nit¬) liªn kÕt víi ba nhãm phosphate. Chóng ta ®· ®Ò cËp ®Õn mét ph©n tö nh− vËy lµ ATP (adenosine triphosphate; xem H×nh 8.8). Sù kh¸c biÖt duy nhÊt gi÷a ph©n tö ATP (cã vai trß trong trao ®æi n¨ng l−îng) víi dATP (lµ tiÒn chÊt cña adenine trong ADN) lµ ë thµnh phÇn ®−êng. NÕu nh− ®−êng trong ADN lµ deoxyribose th× ®−êng trong ATP lµ ribose. Còng gièng nh− ATP, c¸c nucleoside triphosphate ®−îc dïng ®Ó tæng hîp nªn ADN lµ nh÷ng chÊt hãa häc ph¶n øng m¹nh; mét phÇn bëi chóng chøa ®u«i triphosphate vèn tÝch ®iÖn ©m vµ kÐm bÒn. Mçi lÇn mét nucleotide g¾n thªm vµo chuçi ®ang kÐo dµi, hai nhãm phosphate (kÝ hiÖu lµ -i vµ cßn ®−îc gäi lµ pyrophosphate) sÏ ®øt khái ph©n tö nucleoside triphosphate tiÒn chÊt. Sù thñy ph©n diÔn ra ngay sau ®ã cña nhãm pyrophosphate thµnh hai ph©n tö phosphate v« c¬ i ®i liÒn víi c¸c ph¶n øng sinh nhiÖt lµ ®éng lùc ®Ó ph¶n øng trïng hîp ADN diÔn ra (H×nh 16.14). H×nh 16.13 Mét sè protein liªn quan ®Õn khëi ®Çu sao chÐp ADN. C¸c lo¹i protein gièng nhau ho¹t ®éng ë c¶ hai ch¹c sao chÐp cña cïng mét bãng sao chÐp. §Ó gi¶n l−îc, ë ®©y chØ minh häa mét ch¹c sao chÐp. Topoisomerase lµm ®øt g·y c¸c m¹ch ®¬n, th¸o xo¾n råi nèi chóng trë l¹i víi nhau. C¸c protein liªn kÕt m¹ch ®¬n (SSB) gióp lµm æn ®Þnh m¹ch ADN lµm khu«n. Primase tæng hîp ®o¹n måi ARN cã tr×nh tù bæ sung víi m¹ch khu«n. Helicase lµm gi·n xo¾n vµ t¸ch hai m¹ch ®¬n ADN khái nhau. §o¹n måi ARN Ch−¬ng 16 C¬ së di truyÒn häc ph©n tö 315 KÐo dµi chuçi kiÓu ®èi song song Nh− ®· nªu ë trªn, hai ®Çu cña mét m¹ch ADN lµ kh¸c nhau, t¹o cho mçi m¹ch ADN cã tÝnh ph©n cùc, gièng nh− ®−êng mét chiÒu vËy (xem H×nh 16.5). Ngoµi ra, hai m¹ch ADN trong chuçi xo¾n kÐp lµ ®èi song song, nghÜa lµ chóng ph©n cùc theo chiÒu ®èi diÖn nhau, còng gièng nh− hai lµn ®−êng mét chiÒu trªn xa lé theo h−íng ng−îc nhau vËy (xem H×nh 16.14). Râ rµng lµ hai m¹ch míi ®−îc tæng hîp trong qu¸ tr×nh sao chÐp ADN ph¶i ®èi song song so víi c¸c m¹ch khu«n cña chóng. Sù s¾p xÕp ®èi song song cña chuçi xo¾n kÐp ¶nh h−ëng thÕ nµo ®Õn qu¸ tr×nh sao chÐp? Do ®Æc ®iÓm cÊu tróc, c¸c enzym ADN polymerase chØ cã thÓ bæ sung c¸c nucleotide vµo phÝa ®Çu 3’ tù do cña mét ®o¹n måi hoÆc cña mét m¹ch ADN ®ang kÐo dµi, chø kh«ng bao giê bæ sung ®−îc c¸c nucleotide vµo phÝa ®Çu 5’ (xem H×nh 16.14). V× vËy, mét m¹ch ADN míi chØ cã thÓ kÐo dµi theo chiÒu 5’ → 3’. Víi nguyªn t¾c ®ã, hay xem sù sao chÐp diÔn ra thÕ nµo t¹i mét ch¹c sao chÐp (H×nh 16.15). Däc theo mét m¹ch khu«n ADN, ADN polymerase III cã thÓ tæng hîp m¹ch míi mét c¸ch liªn tôc theo nguyªn t¾c bæ sung b»ng viÖc kÐo dµi m¹ch míi theo chiÒu b¾t buéc 5’ → 3’. ADN pol III mét c¸ch ®¬n gi¶n l¸ch vµo ch¹c sao chÐp trªn m¹ch khu«n råi bæ sung liªn tôc c¸c nucleotide vµo m¹ch míi cïng víi viÖc ch¹c sao chÐp tiÕn vÒ phÝa tr−íc. M¹ch ADN míi ®−îc tæng hîp theo kiÓu nµy ®−îc gäi lµ m¹ch dÉn ®Çu. §Ó tæng hîp m¹ch dÉn ®Çu, ADN pol III chØ cÇn mét ®o¹n måi duy nhÊt (xem H×nh 16.15). §Ó cã thÓ kÐo dµi m¹ch ADN míi cßn l¹i theo ®óng chiÒu 5’ → 3’, ADN pol III ph¶i ho¹t ®éng däc theo m¹ch khu«n cßn l¹i theo chiÒu ng−îc h−íng víi chiÒu dÞch chuyÓn cña ch¹c sao chÐp. M¹ch ADN míi ®−îc tæng hîp theo chiÒu ng−îc h−íng nµy ®−îc gäi lµ m¹ch ra chËm hay m¹ch theo sau *. Kh«ng gièng m¹ch dÉn ®Çu ®−îc tæng hîp liªn tôc, m¹ch ra chËm ®−îc tæng hîp gi¸n ®o¹n thµnh c¸c ®o¹n nhá. C¸c ®o¹n cña * Qu¸ tr×nh tæng hîp m¹ch dÉn ®Çu vµ m¹ch theo sau diÔn ra ®ång thêi víi tèc ®é t−¬ng ®−¬ng. Së dÜ gäi lµ m¹ch ra (hay chËm m¹ch theo sau) lµ do sù tæng hîp m¹ch nµy diÔn ra chËm h¬n chót Ýt so víi m¹ch dÉn ®Çu; mçi ph©n ®o¹n míi cña m¹ch ra chËm chØ ®−îc khëi ®Çu tæng hîp khi mét ®o¹n m¹ch khu«n ADN t¹i ch¹c sao chÐp ®· béc lé ®ñ dµi. §Çu 5' §Çu 3' §Çu 5' §Çu 3' ADN polymerase §Çu 5' §Çu 3' §Çu 5' §Çu 3' §−êng Phosphate Nucleoside triphosphate M¹ch míi M¹ch khu«n Pyrophosphate H×nh 16.14 Sù kÕt hîp nucleotide vµo m¹ch ADN. Enzym ADN polymerase xóc t¸c viÖc bæ sung mét nucleoside triphosphate vµo ®Çu 3’ cña mét m¹ch ADN ®ang kÐo dµi, víi sù gi¶i phãng hai nhãm phosphate. Sö dông s¬ ®å nµy ®Ó gi¶i thÝch t¹i sao chóng ta nãi mçi m¹ch ADN cã tÝnh ph©n cùc. ? H×nh 16.15 Tæng hîp m¹ch dÉn ®Çu trong sao chÐp ADN. S¬ ®å nµy tËp trung vµo ch¹c sao chÐp bªn tr¸i cña mét bãng sao chÐp. ADN polymerase III (ADN pol III), ®−îc vÏ gièng nh− bµn tay khum h×nh chÐn, ®Ýnh kÕt chÆt chÏ víi mét protein ®−îc gäi lµ “kÑp tr−ît”, ®−îc vÏ gièng nh− mét chiÕt b¸nh vßng. Protein kÑp tr−ît “®Èy” ADN pol III tr−ît däc m¹ch ADN lµm khu«n. Bãng sao chÐp ADN tæng qu¸t M¹ch dÉn ®Çu M¹ch ra chËm §iÓm khëi ®Çu sao chÐp Måi M¹ch dÉn ®Çu M¹ch ra chËm ChiÒu sao chÐp chung Sau khi ®o¹n måi ARN ®−îc t¹o ra, ADN pol III b¾t ®Çu tæng hîp m¹ch dÉn ®Çu M¹ch dÉn ®Çu ®−îc kÐo dµi liªn tôc theo chiÒu 5’ → 3’ cïng víi chiÒu di chuyÓn cña ch¹c sao chÐp §iÓm khëi ®Çu sao chÐp Måi ARN Protein “kÑp tr−ît” ADN pol III ADN “mÑ” 316 khèi kiÕn thøc 3 Di truyÒn häc m¹ch ra chËm nh− vËy ®−îc gäi lµ c¸c ®o¹n Okazaki theo tªn nhµ khoa häc NhËt b¶n ®· ph¸t hiÖn ra chóng. ë E. coli c¸c ®o¹n Okazaki dµi kho¶ng 1000 ®Õn 2000 nucleotide, trong khi ë sinh vËt nh©n thËt chóng dµi kho¶ng 100 ®Õn 200 nucleotide. H×nh 16.16 minh häa c¸c b−íc cña qu¸ tr×nh tæng hîp m¹ch ra chËm. NÕu nh− ®Ó tæng hîp m¹ch dÉn ®Çu chØ cÇn mét ®o¹n måi duy nhÊt, th× mçi ®o¹n Okazaki trªn m¹ch ra chËm ®Òu cÇn riªng mét ®o¹n måi. Mét lo¹i ADN polymerase kh¸c, gäi lµ ADN polymerase I (ADN pol I) sÏ thay thÕ c¸c nucleotide ARN cña ®o¹n måi b»ng c¸c nucleotide ADN t−¬ng øng b»ng viÖc bæ sung tõng nucleotide vµo ®Çu 3’ cña ®o¹n Okazaki liÒn kÒ (®o¹n sè 2 trªn H×nh 16.16). Tuy vËy, ADN pol I kh«ng thÓ nèi nucleotide cuèi cïng thuéc ®o¹n ADN võa ®−îc thay thÕ víi nucleotide ®Çu tiªn cña ®o¹n Okazaki liÒn kÒ (®o¹n sè 1 trªn H×nh 16.16). Lóc nµy, mét enzym kh¸c, gäi lµ ADN ligase, sÏ thùc hiÖn nhiÖm vô nµy; nã xóc t¸c ph¶n øng nèi khung ®−êng - phosphate cña tÊt c¶ c¸c ®o¹n Okazaki víi nhau ®Ó t¹o nªn m¹ch ADN ra chËm liªn tôc. H×nh 16.16 vµ B¶ng 16.1 m« t¶ tãm t¾t qu¸ tr×nh sao chÐp ADN. H·y ®äc vµ quan s¸t tr−íc khi tiÕp tôc c¸c phÇn d−íi ®©y. Phøc hÖ sao chÐp ADN Tr−íc ®©y, ®Ó dÔ t−ëng t−îng, c¸c ph©n tö ADN polymerase ®−îc m« t¶ gièng nh− c¸c “®Çu xe löa” di chuyÓn däc “®−êng ray” ADN; tuy vËy, h×nh ¶nh ®ã kh«ng chÝnh x¸c ë hai ®iÓm quan träng. Thø nhÊt, “bé m¸y sao chÐp ADN” trong thùc tÕ lµ mét phøc hÖ lín gåm nhiÒu protein kh¸c nhau. C¸c t−¬ng t¸c protein - protein qui ®Þnh hiÖu qu¶ vÒ chøc n¨ng cña phøc hÖ nµy. Ch¼ng h¹n nh−, b»ng sù t−¬ng t¸c víi c¸
File đính kèm:
- Campbel chuong 16 tieng viet.pdf